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藍景科信河北生物科技有限公司
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DAP-seq在NAC轉(zhuǎn)錄因子負調(diào)控水稻對稻瘟病免疫反應中的應用2022/11/15
植物會面臨各種生物和非生物脅迫。為了適應環(huán)境、抵御脅迫，植物進化出了復雜的基因表達重編程機制，從而激活自身免疫反應，在這個過程中往往需要多種不同的轉(zhuǎn)錄因子參與。NAC轉(zhuǎn)錄因子家族是植物基因組中最大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一，也是植物*的轉(zhuǎn)錄因子。水稻中多個ONAC成員參與水稻免疫反應。2022年10月29日，浙江大學農(nóng)業(yè)與生物技術(shù)學院宋鳳鳴課題組的最新研究成果，發(fā)表在學術(shù)期刊JournalofIntegrativePlantBiology上，文章題目為“TheNACtranscriptionfactor
DAP-seq在DELLA參與GA和JA信號通路的靶向調(diào)控的應用2022/11/08
2022年8月20日，廣西大學亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護與利用國家重點實驗室和廣西甘蔗生物學重點實驗室的最新研究成果，在學術(shù)期刊JournalofExperimentalBotany上發(fā)表，文章題目為“ScAIL1modulatesplantdefenseresponsesbytargetingDELLAandregulatingGAａndJAsignaling”。該期刊的影響因子為7.298。該研究使用DAP-seq技術(shù)鑒定了甘蔗ScAIL1轉(zhuǎn)錄因子靶向ScGAI啟動子區(qū)域的結(jié)合基序，進一步研究表
DAP-seq應用于褪黑素促進種子萌發(fā)的分子機制研究2022/11/07
2022年8月，安徽農(nóng)業(yè)大學、中國水稻研究所和上海市農(nóng)業(yè)科學院作物育種栽培研究所在ThePlantJournal（IF=5.726）期刊聯(lián)合發(fā)表了題為“OsSGT1promotesmelatonin-amelioratedseedtolerancetochromiumstressbyaffectingtheOsABI5-OsAPX1transcriptionalmoduleinrice”的文章，揭示了OsSGT1和ABI5相互作用，調(diào)控OsAPX1的表達，促進褪黑素改善種子在鉻污染條件下萌發(fā)的分
DAP-seq技術(shù)在研究木薯響應干旱脅迫分子機制中的應用2022/10/28
木薯（ManihotesculentaCrantz）是一種重要的熱帶作物，是熱帶和亞熱帶干旱地區(qū)的主要糧食作物之一。干旱脅迫嚴重影響木薯的產(chǎn)量和品質(zhì)。鑒定木薯中重要的抗旱基因，對于培育抗旱高產(chǎn)木薯新品種具有非常重要的意義。2022年9月1日，中國熱帶農(nóng)業(yè)科學院熱帶生物技術(shù)研究所功能基因研究組的最新研究成果，在學術(shù)期刊PlantBiotechnologyJournal上發(fā)表，文章題目為“ACC-typeglutaredoxin,MeGRXC3,associateswithcatalasesａndn
客戶文章-DAP-seq在調(diào)控金銀花綠原酸生物合成研究中的應用2022/10/21
綠原酸(CGA)是灰氈毛忍冬(Loniceramacranthoides，別稱：金銀花)最重要的活性藥物成分，在醫(yī)學領(lǐng)域?qū)μ烊籆GA的需求急劇增長。雖然CGA生物合成的關(guān)鍵基因已有報道，但其轉(zhuǎn)錄調(diào)控機制在很大程度上仍然是未知的。因此，研究CGA生物合成的分子調(diào)控機制對于利用基因工程技術(shù)培育高CGA含量的金銀花新品種具有重要意義。2021年4月29日，重慶文理學院園林與生命科學學院陳澤雄教授的研究成果，發(fā)表在植物科學領(lǐng)域的學術(shù)期刊PlantScience上，文章題目為“AR2R3-MYBtrans
客戶文章-DAP-seq應用OsCCA1調(diào)控水稻適應非生物脅迫機制研究2022/09/07
近日，中科院植物所王雷研究組在PlantPhysiology期刊上發(fā)表了題為“RiceCIRCADIANCLOCKASSOCIATED1transcriptionallyregulatesABAsignalingtoconfermultipleabioticstresstolerance”的研究成果。該研究揭示了OsCCA1調(diào)控水稻適應鹽脅迫、干旱脅迫以及滲透脅迫的分子機制。其中，該研究使用了DNA親和純化測序技術(shù)（DAP-seq，DNAAffinityPurificationSequencin
DAP-seq文章-應用于鑒定玉米ZmR1靶基因及對花青素合成調(diào)控研究2022/09/06
近日，北京市農(nóng)林科學院玉米DNA指紋及分子育種北京市重點實驗室、齊魯師范大學玉米分子育種研究院的共同研究成果，于2022年7月5日在TheoreticalａndAppliedGenetics上發(fā)表(影響因子為5.574)，題目為“AnewlycharacterizedalleleofZmR1increasesanthocyanincontentinwholemaizeplantａndtheregulationmechanismofdiferentZmR1alleles”。本文主要研究內(nèi)容是鑒定了
DAP-seq技術(shù)實驗流程和原理和適用物種（對象）范圍2022/09/06
DAP-seq在基因組水平上，鑒定轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點（transcriptionfactorbindingsites,TFBS）非常重要。ChIP-seq是進行體內(nèi)檢測TFBS的主要方法。然而，ChIP-seq依賴于抗體質(zhì)量，這對低表達的蛋白質(zhì)具有很大的挑戰(zhàn)性。所以，ChIP-seq通常在規(guī)模上受到限制，難以進行高通量擴展。因此，只有少數(shù)轉(zhuǎn)錄因子可以獲得結(jié)合位點信息，大量TFBS的覆蓋范圍僅適用于人類和一些模式生物。DAP-seq具有與ChIP-seq同樣的功能。通過體外蛋白表達技術(shù)，表達出帶有
ThePlantCell：DAP-seq應用于水稻氣孔開度調(diào)控機制文章2022/09/06
2022年8月5日，揚州大學江蘇省作物遺傳生理國家重點實驗室、糧食作物現(xiàn)代產(chǎn)業(yè)技術(shù)協(xié)同創(chuàng)新中心的聯(lián)合研究成果在線發(fā)表在ThePlantCell上，文章題目為“Phytochromeinteractingfactorregulatesstomatalaperturebycoordinatingredlightａndabscisicacid”。該期刊的影響因子為12.085。本研究使用DAP-seq技術(shù)發(fā)現(xiàn)水稻OsPIL15轉(zhuǎn)錄因子靶向OsABI5，進一步研究表明，OsPIL15與OsHHO3相互作
DNA Pull Down常見問題2021/11/04
Q1：DNAPullDown的原理是什么？A：DNAPullDown是根據(jù)啟動子區(qū)域，設(shè)計DNA探針并進行生物素標記，標記的探針結(jié)合到鏈霉親和素修飾的磁珠上，形成磁珠-探針復合體。將磁珠-探針復合體與提取的蛋白孵育，鑒定與DNA探針有特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)。Q2：探針的設(shè)計原則是什么，長度為多少個堿基比較合適？A：啟動子的長度一般為100-1000bp，我們建議選擇起始密碼子上游1000bp的序列，根據(jù)這1000bp的序列，來設(shè)計DNA探針。我們建議探針長度在100bp-500bp之間，如果探針序列
ChIP-Seq, DAP-Seq與ATAC-Seq異同及各自優(yōu)勢2021/07/01
染色質(zhì)免疫共沉淀ChromatinImmunoprecipitation,ChIP技術(shù)是在活細胞狀態(tài)下固定蛋白質(zhì)－DNA復合物，并將其隨機切斷為一定長度范圍內(nèi)的染色質(zhì)小片段，然后通過免疫學方法沉淀此復合體，特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA的片段，通過對目的片斷的純化與檢測，從而獲得蛋白質(zhì)與DNA相互作用的信息。該技術(shù)通過蛋白質(zhì)與DNA互作來分析目標基因活性以及已知蛋白質(zhì)的靶基因，被廣泛應用于體內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子與靶基因啟動子上特異核苷酸序列結(jié)合方面的研究。CHIP不僅可以檢測體內(nèi)反式因子與DNA的動
BBRC：DAP-seq解析擬南芥ABA-PIFs信號通路2021/06/25
敏色素互作因子（PIFs）廣泛存在于苔蘚到被子植物中，并在植物從暗形態(tài)建成到光形態(tài)建成的轉(zhuǎn)化過程中發(fā)揮關(guān)鍵調(diào)控作用。PIFs直接與靶基因啟動子區(qū)域的順式作用元件結(jié)合，調(diào)控基因表達，或者與其它調(diào)控因子形成復合物，共同調(diào)控靶基因表達，PIFs是基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的核心，通過整合內(nèi)部和外部的信號以實現(xiàn)對植物體生長發(fā)育的調(diào)控。植物激素脫落酸（AbscisicAcid，ABA）調(diào)控植物的生長發(fā)育和對逆境脅迫的響應。ABA信號通路的很多組分已經(jīng)被鑒定出來。越來越多的證據(jù)證明，ABA與PIFs轉(zhuǎn)錄因子家族在光
DAP-seq助力胡楊耐鹽機制的研究2021/04/07
2019年9月，北京林業(yè)大學和藍景科信合作，在植物學主流學術(shù)期刊JournalofExperimentalBotany上（IF=5.36），發(fā)表了題為“PopuluseuphraticaWRKY1bindsthepromoterofH+-ATPasegenetoenhancegeneexpressionａndsalttolerance”的研究成果。該研究借助DNA親和純化測序技術(shù)（DNAAffinityPurificationSequencing，DAP-seq），深入揭示了胡楊耐鹽的分子機制。
藍景科信DAP-seq（DNA親和純化測序）實驗流程2021/04/01
一、蛋白表達載體構(gòu)建1.1.蛋白表達載體構(gòu)建試劑高保真PCR預混液，瓊脂糖凝膠回收試劑盒，同源重組克隆試劑盒，DH5α感受態(tài)細胞，高純度質(zhì)粒小提試劑盒。1.2.蛋白表達載體構(gòu)建方法1.2.1.根據(jù)基因CDS序列，設(shè)計上游和下游引物并進行引物合成。1.2.2.使用高純度質(zhì)粒小提試劑盒提取含有CDS序列的質(zhì)粒模板，或者使用客戶提供的質(zhì)粒模板，對目的CDS進行PCR擴增。1.2.3.PCR反應程序1.2.4.PCR產(chǎn)物回收PCR結(jié)束后，進行瓊脂糖凝膠電泳。使用瓊脂糖凝膠回收試劑盒，對目的條帶進行膠回收
藍景科信DAP-seq（DNA親和純化測序）已做物種都有什么2021/03/23
（DAP-seq已做物種）DAP-seq已經(jīng)做過的物種都有什么藍景科信是國內(nèi)shoujia商業(yè)化DAP-seq機構(gòu)，具有豐富的實驗經(jīng)驗，專業(yè)高效服務(wù)50多家院校機構(gòu)。藍景科信為您提供DAP-seq全流程技術(shù)服務(wù)和個性化數(shù)據(jù)分析，具有50多個物種，300多個轉(zhuǎn)錄因子的實戰(zhàn)經(jīng)驗。藍景科信DAP-seq已做物種：擬南芥，煙草，水稻，小麥，藜麥，玉米，大豆，棉花，苜蓿，高粱，大麥草，百脈根，油菜，白菜，黃瓜，菜心，番茄，荔枝，香蕉，葡萄，蘋果，柑橘，甜橙，桃，甜瓜，甘蔗，櫻桃，草莓，杜梨，芍藥，棗，核桃
ChIP-seq常見問題（體內(nèi)檢測組蛋白和轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點）2021/03/23
ChIP-seq染色質(zhì)免疫共沉淀測序常見問題1.Input和IP樣本之間的關(guān)系是什么？Input和IP屬于兩個樣本，在前期檢測、建庫、測序都是平行進行的，但是分析中需要將兩個樣本的測序數(shù)據(jù)進行整合分析，得出終的peak結(jié)果，并進行后續(xù)分析。2.Input是什么？有什么作用？我們將DNA或者RNAfragmentation后，在進行免疫沉淀前，需要取一部分斷裂后的染色質(zhì)做Input對照（不進行免疫沉淀過程）。Input是斷裂后的基因組DNA或者RNA，需要與沉淀后的樣品DNA/RNA一起經(jīng)過逆轉(zhuǎn)交
EMSA電泳遷移率實驗中常見的問題（可用于DAP-seq的后續(xù)驗證）2021/03/23
EMSA常見問題1、EMSA原理及方法EMSA稱凝聚阻滯實驗或凝膠電泳遷移率檢測，是一種用于研究轉(zhuǎn)錄因子和其相關(guān)的DNA結(jié)合序列相互作用的技術(shù)，能對各類轉(zhuǎn)錄因子的DNA結(jié)合活性進行定性和半定量分析，是一項研究細胞信號轉(zhuǎn)導通路的關(guān)鍵實驗技術(shù)。EMSA主要基于蛋白-探針復合物在在凝膠電泳過程中遷移較慢的原理。根據(jù)實驗設(shè)計特異性和非特異性探針，當核酸探針與樣本蛋白混合孵育時，樣本中可以與核酸探針結(jié)合的蛋白質(zhì)與探針形成蛋白-探針復合物；這種復合物由于分子量大，在進行聚丙烯酰胺凝膠電泳時遷移較慢，而沒有結(jié)
DAP-seq（DNA親和純化測序）的成功率怎么樣2021/03/23
DAP-seq（DNA親和純化測序）技術(shù)服務(wù)——高通量檢測轉(zhuǎn)錄因子或DNA結(jié)合蛋白在基因組上的結(jié)合位點。DAP-seq技術(shù)的出現(xiàn)，使TFBS的研究不再局限于物種，不再受抗體質(zhì)量的限制，為生命科學和醫(yī)學領(lǐng)域轉(zhuǎn)錄因子的研究提供了新的有效工具。藍景科信為您提供DAP-seq全流程技術(shù)服務(wù)和個性化數(shù)據(jù)分析，具有50多個物種，300多個轉(zhuǎn)錄因子的實戰(zhàn)經(jīng)驗。藍景科信是國內(nèi)shoujia商業(yè)化DAP-seq機構(gòu)，擁有豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗，專業(yè)高效服務(wù)50多家院校單位。DAP-seq成功率怎么樣藍景科信發(fā)表文章列表：
藍景科信DAP-SEQ（DNA親和純化測序）技術(shù)服務(wù)常見問題2021/03/22
DAP-SEQ技術(shù)簡介DAP-SEQ是基于DNA親和純化，通過體外表達轉(zhuǎn)錄因子鑒定TFBS的技術(shù)，具有不受抗體和物種限制，且高通量的優(yōu)勢，自該技術(shù)問世以來，已被廣泛應用于轉(zhuǎn)錄調(diào)控和表觀組學的研究。那么關(guān)于DAP-SEQ都有哪些問題需要關(guān)注呢？1.DAP-seq原理、技術(shù)流程，能解決什么樣的問題?原理：體外表達的蛋白和DNA進行親和純化，將與蛋白結(jié)合的DNA洗脫后進行高通量測序。技術(shù)流程：將編碼轉(zhuǎn)錄因子的CDS序列構(gòu)建到含有親和標簽的載體中，構(gòu)建蛋白表達載體，進行體外蛋白表達，形成轉(zhuǎn)錄因子和親和標
DAP-seq（DNA親和純化測序）新技術(shù)助力轉(zhuǎn)錄因子的研究2021/03/19
DAP-seq新技術(shù)助力轉(zhuǎn)錄因子研究DAP-Seq（DNA親和純化測序）技術(shù)出現(xiàn)：2016年5月，來自美國Salk研究所的科學家們在Cell期刊發(fā)表題為“CistromeａndEpicistromeFeaturesShapetheRegulatoryDNALandscape”的文章（IF=28.71）。該研究開發(fā)了一項新技術(shù)：DAP-Seq（DNA親和純化測序），用于快速繪制轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控靶向DNA區(qū)域的圖譜：順反組（cistrome）的蛋白質(zhì)結(jié)合區(qū)域的景觀圖。構(gòu)建完整的順反組和表觀組圖譜（epi
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