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宏基因組測序服務(wù)(微生物多樣性研究)
微生物群體幾乎存在于世界的每一個(gè)生態(tài)群落之中,且扮演著重要的的角色。傳統(tǒng)的微生物培養(yǎng)及鑒定方法,極大地限制了微生物多樣性資源的研究及開發(fā)利用。宏基因組測序,能夠快速準(zhǔn)確的得到大量生物數(shù)據(jù)和豐富的微生物信息,是研究微生物多樣性和群落特征的重要手段。
技術(shù)原理
2005 年,加州大學(xué)伯克利分校的 Kevin Chen 和Lior Pachter 將宏基因組定文為“應(yīng)用現(xiàn)代基因組學(xué)的技木直接研究自然狀態(tài)下的微生物的有機(jī)群落,而不需要在實(shí)驗(yàn)室中分離單一的菌株”的科學(xué)。宏基因組測序是以特定生境中的整個(gè)微生物群落作為研究對象,提取環(huán)境樣本總 DNA,獲得環(huán)境微生物基因信息總和,研究環(huán)境微生物的群落結(jié)構(gòu)、物種分類、基因功能及代謝網(wǎng)絡(luò)等,具有通量高、速度快、信息全等特點(diǎn),在鑒定低豐度的微生物群落、挖掘更多基因資源方面具有很大優(yōu)勢。
樣本類型
土壤、水體、污泥、腸道物、糞便、皮膚、食品發(fā)酵液等。
技術(shù)路線
樣品準(zhǔn)備
DNA提取
DNA檢測
文庫制備
文庫質(zhì)檢
上機(jī)測序
生信分析
技術(shù)優(yōu)點(diǎn)
應(yīng)用廣
通量高
速度快
數(shù)據(jù)全(不僅可以鑒定微生物群落,還可以挖掘功能基因及其代謝途徑)
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