原始樣品可為細胞、組織、培養(yǎng)上清、免疫沉淀或親和純化的蛋白，以下為定性檢測目的蛋白時細胞樣品的處理方法，其余的樣品制備方法參閱相關(guān)文獻。

1．培養(yǎng)細胞或藥物處理。

2．棄培養(yǎng)基，用1X PBS漂洗細胞2次，去盡殘留培養(yǎng)基。

3．加入1X SDS樣品緩沖液(6-well plate, 100 μl /w或 75 cm2 plate, 500-1000 μl/瓶)，刮落細胞，轉(zhuǎn)移到Ep管。注意：冰上操作。

4．超聲 10~15秒剪切DNA以減低樣品粘性。

5．煮沸樣品5 minutes。

6．離心 12000g, 5 min，取上清。

7．電泳分離：上樣15μl~20 μl 至 SDS-PAGE 膠 ( 10 cm x 10 cm)電泳。
如要定量檢測某蛋白的表達水平，應用RIPA裂解液(1 ml per 107 cells/ 100 mm dish/ 150 cm2 flask)裂解細胞，收集裂解液至離心管中，在振蕩器上混勻4～15min， 14000g離心15min（ 4℃），棄沉淀，用Bradford法或其它蛋白質(zhì)測定方法測定上清中蛋白濃度以調(diào)整上樣體積和上樣量，進行Western雜交時還需設置內(nèi)或外參照，通常用beta-actin。

注意：一般上樣20~30 μg已足夠，如待檢蛋白為低豐度蛋白，可加大上樣量至100μg，但電泳條帶易拖尾，可制備亞細胞組份或采用更敏感的檢測方法。