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GeneStudio S5|S5XL總代 賽默飛ABI Ion GeneStudio S5基因測(cè)序儀

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具體成交價(jià)以合同協(xié)議為準(zhǔn)
  • 型號(hào)GeneStudio
  • 品牌
  • 所在地
  • 更新時(shí)間2023-05-29
  • 廠商性質(zhì)其他
  • 入駐年限1
  • 產(chǎn)品數(shù)量7
  • 人氣值33
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賽默飛ABI Ion GeneStudio S5基因測(cè)序儀 產(chǎn)品詳情

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吳經(jīng)理 134

賽默飛ABI Ion GeneStudio S5基因測(cè)序儀GeneStudio S5|S5XL總代Ion S5系統(tǒng)主要性能

• 無(wú)需復(fù)雜的光路系統(tǒng), Ion Torrent半導(dǎo)體測(cè)序技術(shù)利用天然核苷酸反應(yīng), 實(shí)現(xiàn)高精度的變異捕獲、 極其均一的覆蓋度以及高度的檢測(cè)靈敏度來(lái)探測(cè)低頻變異。
• 相比市場(chǎng)上其他基于光學(xué)檢測(cè)技術(shù)的測(cè)序平臺(tái), IonS5系統(tǒng)幫助希望引入新一代測(cè)序技術(shù)的實(shí)驗(yàn)室降低初期投入成本。
• 支持多種不同價(jià)格和通量的半導(dǎo)體芯片(Ion 510™、Ion 520™、 Ion 530™和Ion 540™芯片), 從而為用戶開展各類DNA/RNA測(cè)序應(yīng)用項(xiàng)目提供更大的靈活性。
• 提供快的新一代測(cè)序儀運(yùn)行速度。
• 依托用戶與技術(shù)社區(qū)-Ion社區(qū)(IonCommunity)-這一社區(qū)目前已擁有超過(guò)3萬(wàn)名會(huì)員,會(huì)員人數(shù)仍在每天增長(zhǎng)中。
• 較小的桌面占用空間, 僅需不到0.5平方米 (儀器尺寸:54.2 x 80.6 x 50.9 cm) 。
• 提供廣泛的文庫(kù)制備方案與試劑盒選擇, 操作簡(jiǎn)單、快速, 起始樣品需求量極低, 適用于微生物測(cè)序、靶向基因測(cè)序、 外顯子組測(cè)序, 以及RNA測(cè)序等廣泛研究應(yīng)用。
• 與Ion Chef™系統(tǒng)或Ion OneTouch™ 2系統(tǒng)配合使用, 實(shí)現(xiàn)簡(jiǎn)易快速的模板制備。
• 通過(guò)整合的T630服務(wù)器與Torrent Suite™軟件, 實(shí)現(xiàn)從堿基識(shí)別到變異解析的完整解決方案。
• 運(yùn)用Ion Reporter™軟件對(duì)配對(duì)樣品DNA變異的檢測(cè)和分析, 提供簡(jiǎn)易和整合的三級(jí)數(shù)據(jù)分析工具。

賽默飛ABI Ion GeneStudio S5基因測(cè)序儀GeneStudio S5|S5XL總代系統(tǒng)流程、 技術(shù)參數(shù)與應(yīng)用

性能描述
簡(jiǎn)捷的靶向測(cè)序流程"簡(jiǎn)單、 快速的自動(dòng)化工作流程: 靶向測(cè)序應(yīng)用中, 從DNA樣品輸入到獲
得分析數(shù)據(jù)*的完整過(guò)程中手工操作不到45分鐘"
• 文庫(kù)制備:
– Ion Xpress Plus片段文庫(kù)試劑盒: 15分鐘(手工操作時(shí)間)
– 使用AB Library Builder實(shí)驗(yàn)方案實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化文庫(kù)制備(13份樣品): 10分鐘(手工操作時(shí)間)
– Ion AmpliSeq靶向富集和建庫(kù)技術(shù):
• 手動(dòng)建庫(kù)方案: 60分鐘(手工操作時(shí)間)
• Ion Chef系統(tǒng)自動(dòng)化建庫(kù)方案: 15分鐘(手工操作時(shí)間)
• 模板制備:
– Ion OneTouch 2系統(tǒng): 模板擴(kuò)增, 手工操作時(shí)間2.5小時(shí)
– Ion Chef系統(tǒng): 模板擴(kuò)增與芯片上樣, 手工操作時(shí)間15分鐘
• 測(cè)序:
– 手工操作時(shí)間少于15分鐘
• 數(shù)據(jù)分析:
– 從5百萬(wàn)讀值數(shù)據(jù)(200 bp測(cè)序反應(yīng))獲得比對(duì)好的BAM文件, 操作時(shí)間不到5小時(shí)"
快速的新一代測(cè)序從DNA樣品到獲得變異結(jié)果快僅需兩個(gè)工作日(8小時(shí)計(jì)算)

• 測(cè)序反應(yīng)僅需2.5-4小時(shí)即可完成


• 使用Ion Xpress Plus片段文庫(kù)試劑盒時(shí), 基因組DNA與擴(kuò)增文庫(kù)制備僅需2.5小時(shí); 使用Ion AmpliSeq靶向富集技術(shù)時(shí), 僅需3.5個(gè)小時(shí)
• 在Ion Chef系統(tǒng)上, 自動(dòng)對(duì)兩塊Ion S5芯片進(jìn)行模板制備與芯片上樣
• 在Ion S5 Torrent服務(wù)器上進(jìn)行數(shù)據(jù)分析, 數(shù)小時(shí)之內(nèi)完成變異檢測(cè)報(bào)告

高度靈活的通量四款芯片分別提供從2百萬(wàn)至8千萬(wàn)的序列通量, 用戶可以根據(jù)需求靈活選擇
每周樣品通量高每周可完成更多數(shù)量樣品的完整靶向測(cè)序工作流程
• 模塊化工作流程設(shè)計(jì), 支持用戶每周(5個(gè)工作日)進(jìn)行多次測(cè)序*: 每臺(tái)Ion S5系統(tǒng)每周可完成多達(dá)10次測(cè)序(200堿基讀值)
• 模塊化工作流程, 研究人員能夠在一臺(tái)Ion S5系統(tǒng)上多可同時(shí)操作384份標(biāo)記樣品, 每周多可檢測(cè)3840份獨(dú)立DNA樣品
* 工作日以8小時(shí)計(jì)算。
簡(jiǎn)捷、 直觀的系統(tǒng)盒裝試劑與友好的用戶界面, 為用戶提供一個(gè)簡(jiǎn)捷的測(cè)序流程
• 在Ion Chef系統(tǒng)、 Ion OneTouch 2系統(tǒng)和Ion S5系統(tǒng)上, 用戶可使用直觀的觸摸界面進(jìn)行編程和操控
• 用戶可通過(guò)固定或移動(dòng)設(shè)備(如iOS和Android設(shè)備)遠(yuǎn)程監(jiān)控Ion S5測(cè)序儀
• 行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)格式(FASTQ、 SFF、 BAM、 VCF), 兼容第三方生物信息學(xué)軟件提供的下游分析和可視化工具。
• 模塊化工作流程, 可在文庫(kù)制備到測(cè)序的每一個(gè)環(huán)節(jié)中實(shí)施質(zhì)量控制, 幫助用戶節(jié)約時(shí)間, 降低試劑成本。
• 通過(guò)盒裝試劑與完整樣品跟蹤功能(RFID掃描)優(yōu)化流程, 提高效率
長(zhǎng)堿基讀長(zhǎng)• 200-、 400-與600-堿基讀長(zhǎng)
• 兼容長(zhǎng)mate-pair讀長(zhǎng)
*硬件牢固而簡(jiǎn)潔的硬件值得您信賴
• 設(shè)計(jì)簡(jiǎn)單, 無(wú)冗余的活動(dòng)零件或復(fù)雜的附屬系統(tǒng), 穩(wěn)健可靠
• 標(biāo)準(zhǔn)臺(tái)式系統(tǒng)(Ion S5系統(tǒng)與Ion Chef系統(tǒng)或Ion OneTouch 2系統(tǒng)), 提供完整擴(kuò)增與測(cè)序工作流程
• 用戶可通過(guò)Ion S5系統(tǒng)的外置條碼閱讀器追溯芯片和樣品, 通過(guò)Ion S5 Torrent服務(wù)器實(shí)現(xiàn)樣品登記
• Ion Chef系統(tǒng)與Ion S5系統(tǒng)采用了*的識(shí)別系統(tǒng), 對(duì)編碼耗材進(jìn)行識(shí)別和追蹤, 并將信息集成至Torrent Suite軟件和/或LIMS系統(tǒng)
• 所有Ion S5系統(tǒng)均由符合ISO 13485標(biāo)準(zhǔn)的工廠生產(chǎn)
緊湊型臺(tái)式系統(tǒng)Ion S5 XL系統(tǒng)僅占用很小的桌面空間
• 尺寸(W x D x L) (近似值): 21.4 x 31.75 x 20 in. (54.2 x 80.6 x 50.9 cm)
• 占用面積: 4.72 平方英尺
• 重量(近似值): 140 lb/63.5 kg
提供完整產(chǎn)品組合高性價(jià)比的新一代測(cè)序平臺(tái), 廣泛適用于各類DNA與RNA研究應(yīng)用
低序列偏性高度均一的覆蓋度及精確的變異檢測(cè)
• Ion 510/520/530 Kit-Chef與Ion 520/530 Kit-OT2能夠?qū)?00和400堿基文庫(kù)進(jìn)行精確、 可靠的測(cè)序
• Ion 540 Kit-Chef與Ion 540 Kit-OT2能夠?qū)?00堿基文庫(kù)進(jìn)行精確、 可靠的測(cè)序
• Ion 520/530 ExT Kit-Chef能夠?qū)?00堿基文庫(kù)進(jìn)行精確、 可靠的測(cè)序
• 通過(guò)簡(jiǎn)單的天然化學(xué)反應(yīng)過(guò)程獲得均一的覆蓋度(即無(wú)偏性)
• 基于天然核苷酸, 聚合酶或核苷酸上無(wú)附著的熒光基團(tuán), 從而實(shí)現(xiàn)長(zhǎng)堿基讀長(zhǎng)和堿基識(shí)別的高保真度

賽默飛ABI Ion GeneStudio S5基因測(cè)序儀GeneStudio S5|S5XL總代半導(dǎo)體測(cè)序

性能描述
無(wú)復(fù)雜光路系統(tǒng)Ion Torrent半導(dǎo)體測(cè)序技術(shù)無(wú)需光路系統(tǒng)
• 無(wú)熒光, 無(wú)攝像頭、 無(wú)激光、 無(wú)LED、 無(wú)光學(xué)元件
由聚合酶介導(dǎo)的簡(jiǎn)單化學(xué)反應(yīng)Ion Torrent半導(dǎo)體測(cè)序技術(shù)基于天然核苷酸反應(yīng), 以及無(wú)需緩沖液即可與核苷酸結(jié)合的高效DNA聚合酶
• 測(cè)序在獨(dú)立的半導(dǎo)體芯片中開展
• 在無(wú)緩沖液反應(yīng)環(huán)境中, DNA聚合酶呈現(xiàn)出色的持續(xù)性與保真度
• 通過(guò)獲得的液流排序算法使核苷酸連續(xù)流過(guò)半導(dǎo)體芯片, 該算法還具有相位錯(cuò)誤糾正能力
• 下一組核苷酸反應(yīng)之前, 上一步反應(yīng)中任何未結(jié)合的殘留核苷酸被充分洗滌去除
• 核苷酸結(jié)合之后, 質(zhì)子從3'端的羥基解離
• 對(duì)質(zhì)子濃度進(jìn)行精確檢測(cè), 該濃度與每一輪獨(dú)立的液流反應(yīng)循環(huán)中參入核苷酸數(shù)量成正比
高質(zhì)量數(shù)據(jù)基于簡(jiǎn)單化學(xué)反應(yīng)過(guò)程, 無(wú)需光路系統(tǒng), 可獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)
• 更長(zhǎng)的堿基讀長(zhǎng)并具有高保真度的堿基識(shí)別能力
• 均一的覆蓋度和高檢測(cè)靈敏度, 更好地探測(cè)低頻變異

賽默飛ABI Ion GeneStudio S5基因測(cè)序儀GeneStudio S5|S5XL總代文庫(kù)制備

性能

描述

簡(jiǎn)單快速的基因組DNA
文庫(kù)制備

Ion Xpress Plus片段文庫(kù)試劑盒為用戶提供了用于基因組和擴(kuò)增子文庫(kù)制備的快速而高度均一的酶切片段化方法

 

• 單人即可在約2小時(shí)內(nèi)完成插入片段100-至400-堿基的基因組DNA文庫(kù)的制備
• 酶切片段化無(wú)需物理剪切, 并兼容自動(dòng)化操作系統(tǒng)(Library Builder系統(tǒng)和自動(dòng)化系統(tǒng))
• 僅需100 ng DNA樣品即可生成無(wú)需擴(kuò)增的測(cè)序文庫(kù)
• Ion Torrent芯片上可對(duì)多達(dá)96個(gè)標(biāo)簽樣品進(jìn)行混合處理, 這種高度多重化的擴(kuò)增子測(cè)序操作,可以實(shí)現(xiàn)單個(gè)樣品中數(shù)以千計(jì)的基因靶標(biāo)的檢測(cè)

簡(jiǎn)單、 快速、 靈活的
靶向測(cè)序

Ion AmpliSeq靶向篩選技術(shù)適用于對(duì)DNA與RNA靶標(biāo)進(jìn)行低起始樣品量、高度多重化、 支持混合樣品的靈活測(cè)序需求

 

• 結(jié)合多重PCR技術(shù), 僅需10 ng FFPE DNA或RNA起始樣品量
• 利用 AmpliSeq Designer工具, 對(duì)任何基因組都能簡(jiǎn)單快速地開展定制設(shè)計(jì)
• 通過(guò)自動(dòng)化引物設(shè)計(jì)實(shí)現(xiàn)簡(jiǎn)單快速的靶向篩選, 僅需數(shù)分鐘
• 對(duì)要求快速處理的樣本, 僅在兩個(gè)8小時(shí)工作日內(nèi)即可完成從基因組DNA樣品輸入到變異檢測(cè)結(jié)果的整個(gè)工作流程, 大幅提升實(shí)驗(yàn)室效率
• 憑借單管12到6144重?cái)U(kuò)增子與96個(gè)標(biāo)簽序列技術(shù), 實(shí)現(xiàn)一次操作處理96份樣品
• 簡(jiǎn)單的PCR工作流程, 無(wú)需額外設(shè)備
• 靈活兼容定制試劑盒與便捷的即用型試劑盒,
• Ion Library Equalizer試劑盒無(wú)需稀釋、 定量或任何附加設(shè)備即可實(shí)現(xiàn)對(duì)Ion Torrent DNA文庫(kù)的均一化處理
• 針對(duì)超過(guò)20000條基因進(jìn)行基因表達(dá)檢測(cè)

構(gòu)建mate-pair文庫(kù)并
開展相關(guān)測(cè)序

Ion TrueMate Plus文庫(kù)試劑盒與高效DNA片段測(cè)序聯(lián)合使用, 為用戶提供簡(jiǎn)單、 快速、 精確的基因組組裝方法

 

• Ion TrueMate技術(shù)適用于高效的mate-pair片段構(gòu)建操作, 同時(shí)實(shí)現(xiàn)小的序列偏性和極低的冗余度
• 僅需2–10 μg DNA起始樣品量

針對(duì)混合微生物群落開
展快速、 全面和廣泛的
研究分析

無(wú)需培養(yǎng)即可快速鑒定多細(xì)菌研究樣品

 

• 可直接使用樣品中的原始材料, 無(wú)需培養(yǎng)、 混合培養(yǎng)或純培養(yǎng)操作
• 針對(duì)多個(gè)微生物變異區(qū)設(shè)計(jì)的引物組, 幫助用戶在種屬水平對(duì)各類細(xì)菌進(jìn)行精確的鑒定
• 兼具靈活性, 引物組分成2管, 單管也可開展獨(dú)立分析
• 可使用標(biāo)簽序列對(duì)引物進(jìn)行標(biāo)記

快速、 簡(jiǎn)單的基因表達(dá)
分析

Ion AmpliSeq轉(zhuǎn)錄組人類基因表達(dá)檢測(cè)試劑盒可檢測(cè)超過(guò)20000條RefSeq收錄的轉(zhuǎn)錄本, 兼容FFPE樣品的快速工作流程僅需低至10 ng RNA起始量

 

• 約1小時(shí)手動(dòng)操作完成文庫(kù)制備, 在兩天內(nèi)即可完成從RNA樣品到獲得基因表達(dá)水平信息的完整流程
• 實(shí)現(xiàn)低成本的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序, 而無(wú)需等待數(shù)周以收集樣品
• 利用現(xiàn)有的下游微陣列或新一代測(cè)序分析技術(shù), 實(shí)現(xiàn)簡(jiǎn)易, 自動(dòng)化的基因差異表達(dá)數(shù)據(jù)分析

快速、 靈活的小RNA
與全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

Ion總RNA測(cè)序v2試劑盒為用戶提供了制備cDNA文庫(kù)的快速方法, 適用于全轉(zhuǎn)錄組或小RNA文庫(kù)的鏈特異性測(cè)序。

 

• 小RNA或全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序所需的文庫(kù)制備通??稍?-6小時(shí)之內(nèi)完成
• 以低至100 ng的poly(A) RNA構(gòu)建文庫(kù), 或以200 ng去除rRNA的總RNA樣品構(gòu)建全轉(zhuǎn)錄組文庫(kù),或以1-100 ng小RNA富集產(chǎn)物構(gòu)建小RNA文庫(kù)
• 保存鏈相關(guān)信息, 以便在相對(duì)于染色體鏈的轉(zhuǎn)錄方向上進(jìn)行數(shù)據(jù)的比對(duì)
• 自動(dòng)化操作, 兼容基于微球的純化操作
• 通過(guò)Invitrogen Ambion RiboMinus真核生物v2試劑盒實(shí)現(xiàn)高效的rRNA清除

高質(zhì)量外顯子組測(cè)序

Ion AmpliSeq外顯子組RDY試劑盒采用了簡(jiǎn)單的PCR富集技術(shù)、 檢測(cè)通量靈活, 包含完整的生物信息學(xué)分析

 

• 通過(guò)簡(jiǎn)單、 快速的特異性PCR技術(shù), 不到60分鐘手工操作完成全外顯子組富集
• 低單外顯子組檢測(cè)成本, 可一次檢測(cè)1-2個(gè)外顯子組, 或每周40小時(shí)的工作時(shí)間內(nèi)檢測(cè)10個(gè)外顯子組, 靈活性
• 整合的軟件與分析流程提供關(guān)于已注釋變異的集中列表
• 高效富集, 靶向數(shù)據(jù)和覆蓋均一度均超過(guò)90%, 大部分測(cè)序深度達(dá)到10x和20x
• 僅需50 ng DNA和2天時(shí)間, 即可完成從DNA樣品到獲得注釋變異的完整流程

適用于所有應(yīng)用的靈
活、 便捷的樣品標(biāo)記

樣品序列標(biāo)簽試劑盒與軟件提升測(cè)序的樣品通量

 

• Ion Xpress序列標(biāo)簽接頭1-96 試劑盒適用于同步分析多重樣品
• Ion Xpress RNA-Seq 序列標(biāo)簽1-16 試劑盒可同步分析多重RNA樣品
• Torrent Suite軟件可同步處理多達(dá)384序列標(biāo)簽

賽默飛ABI Ion GeneStudio S5基因測(cè)序儀GeneStudio S5|S5XL總代模版制備

性能

描述

無(wú)人值守的全自動(dòng)化模
板擴(kuò)增和芯片加載

Ion Chef系統(tǒng)可自動(dòng)完成文庫(kù)在Ion Sphere微粒上的模板制備, 并自動(dòng)將模板加載到Ion S5芯片

 

• 高度自動(dòng)化, 低程度人工干預(yù), 僅需15分鐘手工操作
• 單次運(yùn)行可同時(shí)處理兩塊Ion S5芯片, 完成從文庫(kù)到半導(dǎo)體芯片加載
• 每人每天可完成4份乃至更多文庫(kù)(每份文庫(kù)384樣品序列標(biāo)記)的模板制備工作
• 適合各種操作水平的高通量實(shí)驗(yàn)室或用戶

 

Ion OneTouch 2系統(tǒng)可自動(dòng)完成文庫(kù)在Ion Sphere微粒上的模板制備,
并通過(guò)模塊化設(shè)計(jì)實(shí)現(xiàn)樣品的高通量處理

 

• 整合各種操作水平的高通量實(shí)驗(yàn)室或用戶
• 可與Ion OneTouch 2模板試劑盒配合使用, 在Ion Sphere微粒上穩(wěn)定生成單克隆擴(kuò)增模板, 并加載到Ion S5芯片
• 單人每天可完成4份乃至更多文庫(kù)(每份文庫(kù)多384樣品序列標(biāo)記)的模板制備工作
• 可添加Ion OneTouch 2系統(tǒng), 進(jìn)一步提高Ion S5系統(tǒng)的樣品處理通量
• 針對(duì)低通量實(shí)驗(yàn)室, 這是具性價(jià)比的自動(dòng)化模板制備選項(xiàng)

數(shù)據(jù)分析

性能

描述

單日完成測(cè)序與數(shù)據(jù)分析

Ion S5測(cè)序儀與Ion S5 Torrent服務(wù)器(預(yù)裝Torrent Suite軟件)組合, 為研
究人員提供了從堿基識(shí)別到變異檢測(cè)的完整解決方案

 

• Ion S5 Torrent服務(wù)器與Torrent Suite軟件能夠?qū)x器數(shù)據(jù)快速轉(zhuǎn)換為堿基識(shí)別比對(duì)結(jié)果, 并提供行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)格式的數(shù)據(jù)輸出
• Ion RNA-Seq分析插件: 分析全轉(zhuǎn)錄組RNA測(cè)序的輸出結(jié)果。 本插件能夠生成讀值比對(duì)指標(biāo)、質(zhì)控(QC)指標(biāo)、 基因與轉(zhuǎn)錄本計(jì)數(shù)、 樣品校正熱圖與散點(diǎn)圖, 以及基因與轉(zhuǎn)錄本水平的熱圖
• Ion AmpliSeq RNA插件: 為針對(duì)Ion AmpliSeq轉(zhuǎn)錄組試劑盒的測(cè)序輸出結(jié)果進(jìn)行分析而設(shè)計(jì)。本插件能夠生成讀值比對(duì)指標(biāo)、 質(zhì)控指標(biāo)、 讀值分布散點(diǎn)圖、 樣品校正熱度散點(diǎn)圖、 兼容Excel軟件的報(bào)告以及差異表達(dá)列表
• Torrent變異識(shí)別插件: 識(shí)別純合或雜合的SNP, 以直觀的插件報(bào)告顯示結(jié)果,并能夠識(shí)別頻率低至5%的單堿基變異
• 自動(dòng)鑒定擴(kuò)增子重測(cè)序結(jié)果中的突變, 并通過(guò)廣泛使用的基因組瀏覽器(Integrative GenomicsViewer, 可從broadinstitute.org/igv/home獲取)實(shí)現(xiàn)可視化
• 支持樣品序列標(biāo)記(固定與定制標(biāo)簽)
– 每個(gè)標(biāo)簽都可實(shí)現(xiàn)FASTQ分析和質(zhì)量檢測(cè)
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