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各國(guó)猴痘病毒基因測(cè)序結(jié)果匯總：大規(guī)模社區(qū)傳播需引起警覺(jué)

來(lái)源：北京百奧創(chuàng)新科技有限公司 2022年05月30日 11:47

截至目前，葡萄牙、比利時(shí)、美國(guó)、荷蘭、意大利、西班牙、法國(guó)等多國(guó)的研究團(tuán)隊(duì)發(fā)布猴痘病毒基因測(cè)序報(bào)告，根據(jù)測(cè)序報(bào)告和進(jìn)化樹(shù)對(duì)比，表明猴痘可能已經(jīng)在歐洲發(fā)生了大規(guī)模的社區(qū)傳播。
各國(guó)猴痘基因組測(cè)序情況匯總?cè)缦聢D：

報(bào)告時(shí)間	國(guó)家	測(cè)序平臺(tái)	測(cè)序方法	平均測(cè)序深度	結(jié)果
5月19日	葡萄牙	Oxford Nanopore MinION	NQ法宏基因組測(cè)序	7倍	基因進(jìn)化樹(shù)分析草案顯示，分離出來(lái)的病毒與2018年和2019年從尼日利亞傳播到英國(guó)、以色列和新加坡的病毒有密切關(guān)系
5月23日	葡萄牙	Illumina	高通量NQ法宏基因組測(cè)序法	201倍(平均)	這次多國(guó)猴痘暴發(fā)很可能只有一個(gè)源頭，迄今為止公布的所有BD基因序列都緊緊聚集在一個(gè)分支上(美國(guó)公布的病毒基因組序列(MPXV_USA_2022_MA001)相比較)
5月19日	德國(guó)	Illumina			該菌株分類為西非分支，與最近來(lái)自歐洲和美國(guó)的菌株相關(guān)
5月20日	比利時(shí)	Oxford Nanopore MinION	非靶向宏基因組	18.9倍	比利時(shí)猴痘病毒基因組（ITM_MPX_1）也屬于猴痘病毒的西非分支，與最近上傳的葡萄牙疫情基因組關(guān)系最為密切
5月20日	美國(guó)	Oxford Nanopore MinION			僅僅公布猴痘患者所攜帶病毒的基因測(cè)序結(jié)果
5月26日	荷蘭	Oxford Nanopore MinION		10倍	病毒在進(jìn)化樹(shù)上與此前葡萄牙團(tuán)隊(duì)公布的基因組樣本極為相似，與關(guān)系最為密切的一份葡萄牙樣本相比，只出現(xiàn)了2個(gè)單核苷酸多樣性位點(diǎn)(SNP s)
5月27日	意大利	Illumina		19倍	獲得的基因組屬于MPXV的西非分支，與最近從葡萄牙疫情上傳的基因組關(guān)系最為密切，這進(jìn)一步證明了歐洲的大規(guī)模社區(qū)傳播
5月27日	西班牙	Illumina		77倍	該病毒基因組同屬猴痘病毒西非進(jìn)化支，與關(guān)系最密切的葡萄牙一支序列相比，單核苷酸多樣性位點(diǎn)(SNPs)小于4個(gè)，與德國(guó)序列相比，單核苷酸多樣性位點(diǎn)(SNPs)為2個(gè)
5月28日	法國(guó)	Illumina	宏基因組下一代測(cè)序	950倍	相較于2018年在英國(guó)發(fā)現(xiàn)的猴痘病毒基因，這四份病毒基因樣本出現(xiàn)了46個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)((SNPs)和3個(gè)缺失

上述的測(cè)序結(jié)果都表明：本輪猴痘疫情爆發(fā)極有可能來(lái)自一個(gè)源頭，都屬于西非分支；同時(shí)，猴痘在歐洲已經(jīng)出現(xiàn)大規(guī)模社區(qū)傳播。
目前多個(gè)國(guó)家通過(guò)社交應(yīng)用程序、社交媒體醫(yī)療服務(wù)機(jī)構(gòu)等多種渠道提醒，大規(guī)模社區(qū)傳播需引起警覺(jué)。
北京百奧創(chuàng)新科技有限公司提供基因測(cè)序服務(wù)，助力猴痘病毒基因組測(cè)序，歡迎咨詢。

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