GenePix 4000B 微陣列基因芯片掃描儀
這種掃描儀是芯片掃描技術(shù)在質(zhì)量,可靠性和易于使用方面的基準(zhǔn)。分辨率 5-100 微米/Pixel,且用戶可調(diào),2 個(gè)濾光片,2 個(gè)激光選擇,同時(shí)掃描。
產(chǎn)品概述:
GenePix 4000B 是 MD 公司推出的一款具有雙固態(tài)激光光源和雙檢測(cè)器的微陣列基因芯片掃描儀,與市面上大多數(shù)微陣列基因芯片掃描儀有所不同,GenePix 4000B 掃描儀可以同時(shí)利用雙波長激發(fā)芯片后同時(shí)獲取數(shù)據(jù)。減少了掃描時(shí)間(雙通道掃描10um 的分辨率,6.5分鐘,掃描區(qū)域越小時(shí)間會(huì)更少)。除了出眾的速度,同時(shí)掃描時(shí)也實(shí)時(shí)顯示出數(shù)據(jù)比值,數(shù)據(jù)采集過程中實(shí)時(shí)評(píng)估圖像質(zhì)量。具有這種高性能可以確保獲得精確的比值。
主要特點(diǎn):
1.采用非共聚焦光路設(shè)計(jì):采用非共聚焦光路的 GenePix 4000B 可有效針對(duì)微陣列基因芯片表面為非均一平面設(shè)計(jì),傳統(tǒng)由于受到共聚焦成像系統(tǒng)具有非常窄的景深,會(huì)受到各種不同基質(zhì)載體的焦平面的變化而產(chǎn)生波動(dòng)。
2.雙激光同步掃描:GenePix 4000B 掃描儀可以同時(shí)利用雙波長激發(fā)芯片后同時(shí)獲取數(shù)據(jù)??纱蟠鬁p少了掃描時(shí)間,提高實(shí)驗(yàn)室效率。
3.PMT 自動(dòng)平衡技術(shù)以及分辨率調(diào)節(jié)技術(shù)于一體:GenePix 4000B 支持用戶在5-100 μm范圍內(nèi)隨意調(diào)節(jié)其分辨率來獲取數(shù)據(jù)??舍槍?duì)具體實(shí)驗(yàn)的需求優(yōu)化圖像分辨率和文件的大小,并且儀具有自動(dòng)調(diào)節(jié)PMT 增益的功能,可簡便、快速對(duì)信號(hào)強(qiáng)度和通道的平衡進(jìn)行優(yōu)化。
4.樣本的兼容性:GenePix 4000B 基因芯片掃描儀支持用戶通過調(diào)節(jié)焦點(diǎn)位置和激光器能量的高低,可以提高針對(duì)不同類型樣本的兼容性。焦距可調(diào)滿足用戶使用凹凸不平的芯片載體,如膜包被芯片或嵌入式芯片,可以獲取更高的圖像質(zhì)量。
應(yīng)用領(lǐng)域:
基因芯片技術(shù):DNA 基因表達(dá)、陣列比較基因組雜交 (aCGH)、染色質(zhì)免疫沉淀 (ChIP-on-Chip)、拷貝數(shù)變化 (CNV)、DNA 甲基化、SNP 分型、雜交測(cè)序、RNAi 和 microRNA 檢測(cè)
蛋白芯片技術(shù):蛋白質(zhì)組學(xué)、ELISA、抗體芯片、抗原芯片、蛋白-蛋白結(jié)合、蛋白-細(xì)胞相互作用、組織微陣列、細(xì)胞微陣列、碳水化合物微陣列、化合物微陣列、微流控芯片、納米技術(shù)微陣列
實(shí)驗(yàn)舉例:
正常情況下,人類基因組“垃圾”序列的 CpG 二核苷酸相對(duì)稀少,并且總是處于甲基化狀態(tài),與之相反,人類基因組中大小為100-1000 bp 左右,富含 CpG 二核苷酸的 CpG 島則總是處于未甲基化狀態(tài),并且 CpG 島常位于轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)附近,與56%的人類基因組編碼基因相關(guān),因此基因轉(zhuǎn)錄區(qū) CpG 島的甲基化狀態(tài)的研究就顯得十分重要。利用芯片掃描儀可分析測(cè)試 DNA 的甲基化水平并與參考 DNA 進(jìn)行比較。