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逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng) ( (Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)該技術(shù)主要用于:分析基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物、獲取目的基因、合成cDNA探針、構(gòu)建RNA高效轉(zhuǎn)錄系統(tǒng)。
反應(yīng)注意事項:
1.在實驗過程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在總RNA的提取過程中,注意避免mRNA的斷裂。
2.為了防止非特異性擴增,必須設(shè)陰性對照。
3.內(nèi)參的設(shè)定:主要為了用于靶RNA的定量。常用的內(nèi)參有G3PD(甘油醛-3-磷酸脫氫酶)、β-Actin(β-肌動蛋白)等。其目的在于避免RNA定量誤差、加樣誤差以及各PCR反應(yīng)體系中擴增效率不均一各孔間的溫度差等所造成的誤差。
4. PCR不能進入平臺期,出現(xiàn)平臺效應(yīng)與所擴增的目的基因的長度、序列、二級結(jié)構(gòu)以及目標(biāo)DNA起始的數(shù)量有關(guān)。故對于每一個目標(biāo)序列出現(xiàn)平臺效應(yīng)的循環(huán)數(shù),均應(yīng)通過單獨實驗來確定。
5.防止DNA的污染:
① 采用DNA酶處理RNA樣品;
② 在可能的情況下,將PCR引物置于基因的不同外顯子,以消除基因和mRNA的共線性。
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