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?變性瓊脂糖凝膠電泳測(cè)定過(guò)程

時(shí)間:2023/1/29閱讀:616
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   實(shí)時(shí)熒光定量PCR (Quantitative Real-time PCR)是一種在DNA擴(kuò)增反應(yīng)中,以熒光化學(xué)物質(zhì)測(cè)每次聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。通過(guò)內(nèi)參或者外參法對(duì)待測(cè)樣品中的特定DNA序列進(jìn)行定量分析的方法。  變性瓊脂糖凝膠電泳測(cè)定過(guò)程:

1、制膠
1 g瓊脂糖溶于72 ml水中,冷卻至60℃,10 ml的10 x MOPS電泳緩沖液和18 ml的37% jia醛溶液(12.3 M)。
10x MOPS電泳緩沖液
濃度  成分
0.4 M  MOPS,pH 7.0
0.1 M  乙酸鈉
0.01 M  EDTA 
灌制凝膠板,預(yù)留加樣孔至少可以加入25 μl溶液。膠凝后取下梳子,將凝膠板放入電泳槽內(nèi),加足量的1xMOPS電泳緩沖液至覆蓋膠面幾個(gè)毫米。

2、準(zhǔn)備RNA樣品
取3 ugRNA,加3倍體積的甲醛上樣染液,加EB于甲醛上樣染液中至終濃度為10 ug/ml。加熱至70℃孵育15分鐘使樣品變性。
 
3、電泳
 上樣前凝膠須預(yù)電泳5 min,隨后將樣品加入上樣孔。5-6 V/cm電壓下2 h,電泳至溴酚蘭指示劑進(jìn)膠至少2-3 cm。
 
4、紫外透射光下觀(guān)察并拍照 
28S和18S核糖體RNA的帶非常亮而濃(其大小決定于用于抽提RNA的物種類(lèi)型),上面一條帶的密度大約是下面一條帶的2倍。還有可能觀(guān)察到一個(gè)更小稍微擴(kuò)散的帶,它由低分子量的RNA(tRNA和5S核糖體RNA)組成。在18S和28S核糖體帶之間可以看到一片彌散的EB染色物質(zhì),可能是由mRNA和其它異型RNA組成。RNA制備過(guò)程中如果出現(xiàn)DNA污染,將會(huì)在28S核糖體RNA帶的上面出現(xiàn),即更高分子量的彌散遷移物質(zhì)或者帶,RNA的降解表現(xiàn)為核糖體RNA帶的彌散。用數(shù)碼照相機(jī)拍下電泳結(jié)果。

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