ELISA試劑盒的新技術(shù)
你可以將人類基因組看作是由30億堿基構(gòu)成的一本神秘的天書。Frey說:“在過去的十年里,科學(xué)家們做出了極大的努力來尋找基因組中的致病突變,卻缺乏一種理性方法來了解它們的致病原因。這是因為科學(xué)家們沒有找到一種方法來了解基因組這本天書,以及基因組突變改變文本含義的機制。"麻省理工學(xué)院生物學(xué)家Eric Lander有句名言:“基因組。你購買了這本天書。卻難于讀懂它。"
那Frey的方法是什么呢?我們知道這本天書中某些稱作為外顯子的部分,描繪了作為所有活細胞組成構(gòu)件的蛋白質(zhì)。然而直到zui近都仍未重視稱作為內(nèi)含子的其他部分,內(nèi)含子中包含了剪切和粘貼外顯子的指令,其決定了生成哪一種蛋白質(zhì)。在細胞將DNA轉(zhuǎn)換為蛋白質(zhì)的過程中這一“剪接"程序是至關(guān)重要的一步,*其遭到破壞可促成許多的疾病(延伸閱讀:Nature頭條:解密剪接密碼 預(yù)測DNA動向)。
大多數(shù)調(diào)查疾病遺傳根源的研究都將焦點放在外顯子內(nèi)部的突變上,然而科學(xué)家們?nèi)找姘l(fā)現(xiàn)這些突變無法解釋疾病。Frey研究小組采用了一種*不同的方法:檢測為剪接提供指令的文本所發(fā)生的改變,其中大部分存在于內(nèi)含子中。
Frey研究小組采用了一種叫做“深入學(xué)習(xí)"(deep learning)的新技術(shù),來教授計算機系統(tǒng)掃描DN段,讀取如何拼接外顯子的遺傳指令,及確定將生成哪種蛋白質(zhì)。
不同于其他的機器學(xué)習(xí)方法,這一技術(shù)可以闡明難以置信復(fù)雜關(guān)系的含義,例如那些存在于活體系統(tǒng)中的復(fù)雜關(guān)系在生物學(xué)和醫(yī)學(xué)中的意義。Frey說:“我們的項目能夠取得成功關(guān)鍵在于利用了的深入學(xué)習(xí)方法來分析的實驗生物學(xué)數(shù)據(jù)。我的合作者和我們的研究生及博士后工作人員都是這些領(lǐng)域的*專家。"
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