甲醛洋菜膠體電泳 （formaldehyde-agarose gel electrophoresis）甲醛是一種常用的RNA 變性劑。在進(jìn)行甲醛洋菜膠體電泳分析時(shí)，必須先配制含有甲醛的洋菜膠體，RNA 也必須先以甲醛及formamide 進(jìn)行變性處理，以確保其二度結(jié)構(gòu)充分被打開(kāi)。由于甲醛可能是一種致癌物質(zhì)，配制膠體及進(jìn)行電泳分析時(shí)都應(yīng)在抽氣櫥里小心操作；進(jìn)行電泳時(shí)所使用的緩沖液為MOPS （3-[N-morpholino] propanesulfonic acid）。此外，含有甲醛的洋菜膠體比較滑溜，容易破裂，在移動(dòng)膠體時(shí)應(yīng)特別留神。由于rRNA 占細(xì)胞RNA總量的80~85%，以ethidium bromide 染色后，呈現(xiàn)于膠體上的兩個(gè)主要RNA色帶應(yīng)該分別是large 與small rRNAs （真核生物為28S 與18S，原核生物為23S 與16S）；散布于small rRNA 附近，呈淡淡smear 的就是mRNAs，這是因?yàn)閙RNAs 存在量不多，而且長(zhǎng)度不一的緣故。長(zhǎng)度較短的5S rRNA 及tRNA 等則在膠體下方也以特定色帶呈現(xiàn)。