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DAP-seq與RNA-seq聯(lián)合分析助力揭示AvERF73參與調(diào)控低氧應(yīng)答和甲羥戊酸途徑2024/4/24

澇害（Waterlogging）是長(zhǎng)期陰雨或暴雨后，由于地表積水，地面徑流不能及時(shí)排除，積水深度過大，時(shí)間過長(zhǎng)，造成作物根部氧氣不足，并產(chǎn)生乙醇等有毒有害物質(zhì)，從而影響作物生長(zhǎng)，甚至造成作物死亡，造成...

文章分享：應(yīng)用Ribo-seq技術(shù)量化tRNA對(duì)乳腺癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移的調(diào)控2024/4/10

技術(shù)簡(jiǎn)介Ribo-seq，又稱為RibosomeProfiling或者翻譯組測(cè)序，能夠?qū)εc核糖體結(jié)合并正在被翻譯的約30nt的mRNA片段進(jìn)行測(cè)序，詳細(xì)檢測(cè)體內(nèi)的翻譯狀態(tài)，Ribo-seq是連接轉(zhuǎn)錄組...

Ribo-seq：檢測(cè)正在翻譯的mRNA信息，連接轉(zhuǎn)錄組學(xué)與蛋白質(zhì)組學(xué)的橋梁2024/3/5

技術(shù)原理蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的主要承擔(dān)者,翻譯調(diào)控又是細(xì)胞內(nèi)重要的調(diào)控方式。翻譯是核糖體讀取mRNA模板來指導(dǎo)蛋白質(zhì)合成的過程,是基因表達(dá)的關(guān)鍵步驟。翻譯的過程受到嚴(yán)格的調(diào)控,很多疾病與翻譯異常相關(guān),比如...

DAP-seq鑒定BcERF070下游靶基因，揭示乙烯調(diào)控小白菜開花機(jī)制2024/2/22

不結(jié)球白菜（Pak-choi），俗稱小白菜，是一種原產(chǎn)于中國(guó)的多葉狀蔬菜，已逐漸在世界范圍內(nèi)種植。小白菜易于早熟的特性，限制了生長(zhǎng)發(fā)育和產(chǎn)量積累。因此，了解小白菜的開花調(diào)控機(jī)制對(duì)育種和產(chǎn)業(yè)具有重要意義...

DNA pull down技術(shù)助力揭示AP2/ERF類轉(zhuǎn)錄因子提高芍藥耐高溫能力的分子機(jī)制2024/1/31

芍藥是一種傳統(tǒng)的中藥材，并且具有欣賞價(jià)值，其生長(zhǎng)發(fā)育經(jīng)常受到高溫脅迫的影響。褪黑素是一種內(nèi)源性微分子吲哚胺化合物，在各種生物體中具有多種生理功能，大量研究表明調(diào)節(jié)與褪黑素生物合成相關(guān)的基因來提高植物對(duì)...

應(yīng)用HaloTag pull-down技術(shù)鑒定了與胡楊CPK21互作的重金屬脅迫相關(guān)蛋白2024/1/29

鎘(Cd)污染因其毒性在全球范圍內(nèi)造成了嚴(yán)重的生態(tài)問題，重金屬對(duì)植物造成的傷害除了離子毒害效應(yīng)，還會(huì)影響植物的水分狀況，造成植物生理干旱。當(dāng)前，干旱也已成為全球農(nóng)林業(yè)生產(chǎn)和發(fā)展的重大威脅。胡楊（Pop...

轉(zhuǎn)錄因子PpNAC1和DNA去甲基酶PpDML1協(xié)同調(diào)控桃果實(shí)成熟2024/1/22

2023年11月22日，浙江大學(xué)張波教授課題組研究成果，發(fā)表在PlantPhysiology期刊上（影響因子7.4），文章題目為TranscriptionfactorPpNAC1ａndDNAdemet...

DAP-seq技術(shù)助力揭示MdBPC2轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控生長(zhǎng)素的合成從而調(diào)控蘋果性狀2024/1/15

植物生長(zhǎng)素（IAA）在植物生長(zhǎng)發(fā)育過程中起著重要的作用。其化學(xué)本質(zhì)是吲哚乙酸。主要作用是使植物細(xì)胞壁松弛，從而使細(xì)胞生長(zhǎng)伸長(zhǎng)，在許多植物中還能增加RNA和蛋白質(zhì)的合成。目前BARLEYBRECOMBI...

DAP-seq技術(shù)在R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子LmMYB15調(diào)控金銀花分子機(jī)制研究中的應(yīng)用2023/11/15

綠原酸(CGA)是灰氈毛忍冬(Loniceramacranthoides，別稱：金銀花)最重要的活性藥物成分，在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域?qū)μ烊籆GA的需求急劇增長(zhǎng)。雖然CGA生物合成的關(guān)鍵基因已有報(bào)道，但其轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)...

DAP-seq技術(shù)在ScAIL1靶向調(diào)控DELLA參與GA和JA信號(hào)通路的應(yīng)用2023/11/15

2022年8月20日，廣西大學(xué)亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護(hù)與利用國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和廣西甘蔗生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的最新研究成果，在學(xué)術(shù)期刊JournalofExperimentalBotany上發(fā)表，文章題目為“S...

DAP-seq技術(shù)揭示花生中AhTWRKY24和AhTWRKY106轉(zhuǎn)錄因子下游調(diào)控基因2023/11/3

2023年6月4日，青島農(nóng)業(yè)大學(xué)草業(yè)學(xué)院宋輝教授課題組的研究成果，發(fā)表在OilCropScience期刊上，文章題目為IdentificationofthetargetgenesofAhTWRKY24...

DAP-seq助力揭示YABBY11轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控楊樹葉形自然變異的分子機(jī)制2023/10/30

2023年3月，北京林業(yè)大學(xué)生物學(xué)院宋躍朋教授課題組的研究成果發(fā)表在了PlantPhysiology期刊上（影響因子7.4），文章題目為“Enhancedgenome-wideassociationr...

植物轉(zhuǎn)錄因子研究策略及方法2023/10/11

植物轉(zhuǎn)錄因子研究轉(zhuǎn)錄因子（TF）是一類具有特殊結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)，也稱為反式作用因子。通過與靶基因啟動(dòng)子區(qū)域的順式作用元件特異性結(jié)合，行使調(diào)控基因表達(dá)的功能。典型的轉(zhuǎn)錄因子一般具有4個(gè)功能結(jié)構(gòu)域：DNA結(jié)合...

New Phytologist：DAP-seq技術(shù)在陸地棉體細(xì)胞胚胎發(fā)生調(diào)控機(jī)制研究中的應(yīng)用2023/8/8

體細(xì)胞胚胎發(fā)生（Somaticembryogenesis,SE）可以不經(jīng)過配子融合，由體細(xì)胞分化發(fā)育成整個(gè)植株。SE是一個(gè)多因素的發(fā)育過程，也是研究細(xì)胞全能性的理想模型。目前，SE在多個(gè)領(lǐng)域得到了應(yīng)用...

siPOOLs常見問題解答（FAQ）2023/8/7

1.siPOOLs如何提高基因敲低的特異性和效率？siPOOL是一款包含30條siRNAs的、高復(fù)雜度的混池，通過降低每條siRNA的實(shí)驗(yàn)相關(guān)性以稀釋其脫靶效應(yīng)。專有的siPOOL設(shè)計(jì)算法，可確保較高...