定量PCR方法:
a、競爭法
選擇由突變克隆產(chǎn)生的含有一個新內(nèi)切位點的外源競爭性模板。在同一反應(yīng)管中,待測樣品與競爭模板用同一對引物同時擴增(其中一個引物為熒光標(biāo)記)。擴增后用內(nèi)切酶消化PCR產(chǎn)物,競爭性模板的產(chǎn)物被酶解為兩個片段,而待測模板不被酶切,可通過電泳或高效液相將兩種產(chǎn)物分開,分別測定熒光強度,根據(jù)已知模板推測未知模板的起始拷貝數(shù)。
b、內(nèi)參照法
在不同的PCR反應(yīng)管中加入已定量的內(nèi)標(biāo)和引物,內(nèi)標(biāo)用基因工程方法合成。上游引物用熒光標(biāo)記,下游引物不標(biāo)記。在模板擴增的同時,內(nèi)標(biāo)也被擴增。在PCR產(chǎn)物中,由于內(nèi)標(biāo)與靶模板的長度不同,二者的擴增產(chǎn)物可用電泳或高效液相分離開來,分別測定其熒光強度,以內(nèi)標(biāo)為對照定量待檢測模板。
c、PCR-ELISA法
利用di高辛或生物素等標(biāo)記引物,擴增產(chǎn)物被固相板上特異的探針?biāo)Y(jié)合,再加入抗di高辛或生物素酶標(biāo)抗體-辣根過氧化物酶結(jié)合物,終酶使底物顯色。常規(guī)的PCR-ELISA法只是定性實驗,若加入內(nèi)標(biāo),作出標(biāo)準(zhǔn)曲線,也可實現(xiàn)定量檢測目的。
PCR在分子克隆和DNA分析中有多種用途,下面就向大家介紹PCR實驗方法步驟:
方法
1:在冰浴中,按以下次序?qū)⒏鞒煞旨尤胍粺o菌0.5ml離心管中。
10×PCR buffer
5 μl dNTP mix (2mM)
4 μl 引物1(10pM)
2 μl 引物2(10pM)
2 μl Taq酶 (2U/μl)
1 μl DNA模板(50ng-1μg/μl)
1 μl 加ddH2O至 50 μl
產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 | 貨號 |
6-FAM 亞磷酰胺單體 | 100mg/1g | BJP1266 |
熒光定量PCR原理:
產(chǎn)品僅用于科研熒光定量PCR早稱TaqMan PCR,后來也叫Real-Time PCR,是美國PE(Perkin Elmer)公司1995年研制出來的一種新的核酸定量技術(shù)。該技術(shù)是在常規(guī)PCR基礎(chǔ)上加入熒光標(biāo)記探針或相應(yīng)的熒光染料來實現(xiàn)其定量功能的。其原理:隨著PCR反應(yīng)的進行,PCR反應(yīng)產(chǎn)物不斷累計,熒光信號強度也等比例增加。每經(jīng)過一個循環(huán),收集一個熒光強度信號,這樣我們就可以通過熒光強度變化監(jiān)測產(chǎn)物量的變化,從而得到一條熒光擴增曲線圖。
一般而言,熒光擴增曲線可以分成三個階段:熒光背景信號階段,熒光信號指數(shù)擴增階段和平臺期。在熒光背景信號階段,擴增的熒光信號被熒光背景信號所掩蓋,無法判斷產(chǎn)物量的變化。而在平臺期,擴增產(chǎn)物已不再呈指數(shù)級的增加,PCR 的終產(chǎn)物量與起始模板量之間沒有線性關(guān)系,根據(jù)終的 PCR 產(chǎn)物量也不能計算出起始 DNA 拷貝數(shù)。只有在熒光信號指數(shù)擴增階段, PCR產(chǎn)物量的對數(shù)值與起始模板量之間存在線性關(guān)系,我們可以選擇在這個階段進行定量分析。為了定量和比較的方便,在實時熒光定量 PCR 技術(shù)中引入了兩個非常重要的概念:熒光閾值和 CT值。
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實時熒光定量PCR:
實時熒光定量PCR技術(shù)有效地解決了傳統(tǒng)定量只能終點檢測的局限,實現(xiàn)了每一輪循環(huán)均檢測一次熒光信號的強度,并記錄在電腦軟件之中,通過對每個樣品Ct值的計算,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線獲得定量結(jié)果。因此,實時熒光定量PCR無需內(nèi)標(biāo)是建立在兩個基礎(chǔ)之上的:
1)Ct值的重現(xiàn)性PCR循環(huán)在到達(dá)Ct值所在的循環(huán)數(shù)時,剛剛進入真正的指數(shù)擴增期(對數(shù)期),此時微小誤差尚未放大,因此Ct值的重現(xiàn)性*,即同一模板不同時間擴增或同一時間不同管內(nèi)擴增,得到的Ct值是恒定的。
2)Ct值與起始模板的線性關(guān)系由于Ct值與起始模板的對數(shù)存在線性關(guān)系,可利用標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知樣品進行定量測定,因此,實時熒光定量PCR是一種采用外標(biāo)準(zhǔn)曲線定量的方法。
外標(biāo)準(zhǔn)曲線的定量方法相比內(nèi)標(biāo)法是一種準(zhǔn)確的、值得信賴的科學(xué)方法。利用外標(biāo)準(zhǔn)曲線的實時熒光定量PCR是迄今為止定量準(zhǔn)確,重現(xiàn)性的定量方法,已得到*的*,廣泛用于基因表達(dá)研究、轉(zhuǎn)基因研究,藥物療效考核、病原體檢測等諸多領(lǐng)域。
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實驗過程:
一、試劑準(zhǔn)備
1. DNA模板
2.對應(yīng)目的基因的特異引物(在PCR反應(yīng)中,新合成的DNA是要接在一小段序列上才能繼續(xù)按照模板DNA復(fù)制,而不能從無到有,憑空合成。這一小段序列就是你所要有設(shè)計的引物??梢允荄NA也可以是RNA,一般20多bp,需要根據(jù)你的模板鏈設(shè)計。因此,擴增不同的基因需要設(shè)計不同的引物)
3.10×PCR Buffer
4.2mM dNTPmix:含dATP、dCTP、dGTP、dTTP各2mM
5.Taq酶
二、操作步驟
1.在冰浴中,按以下次序?qū)⒏鞒煞旨尤胍粺o菌0.5ml離心管中。
10×PCR buffer 5μl
dNTP mixl 4μl
引物1(10pM) 2μl
引物2(10PM) 2μl
Taq酶(2U/μl) 1μl
DNA模板(50ng-1μg/μl) 1 μl
加ddH2O至 50 μl
視PCR儀有無熱蓋,不加或添加石蠟油。
2.調(diào)整好反應(yīng)程序。將上述混合液稍加離心,立即置PCR儀上,執(zhí)行擴增。一般:在93℃預(yù)變性3-5min,進入循環(huán)擴增階段:93℃ 40s → 58℃ 30s → 72℃ 60s,循環(huán)30-35次,zui后在72℃ 保溫7min。
3.結(jié)束反應(yīng),PCR產(chǎn)物放置于4℃待電泳檢測或-20℃長期保存。
4.PCR的電泳檢測:如在反應(yīng)管中加有石蠟油,需用100μlLuFang進行抽提反應(yīng)混合液,以除去石蠟油;否則,直接取5-10μl電泳檢測。
三、注意事項
1.PCR反應(yīng)應(yīng)該在一個沒有DNA污染的干凈環(huán)境中進行。設(shè)立一個的PCR實驗室。
2.純化模板所選用的方法對污染的風(fēng)險有極大影響。一般而言,只要能夠得到可靠的結(jié)果,純化的方法越簡單越好。
3.所有試劑都應(yīng)該沒有核酸和核酸酶的污染。操作過程中均應(yīng)戴手套。
4.PCR試劑配制應(yīng)使用zui高質(zhì)量的新鮮雙蒸水,采用0.22μm濾膜過濾除菌或高壓滅菌。
5.試劑都應(yīng)該以大體積配制,試驗一下是否滿意,然后分裝成僅夠一次使用的量儲存,從而確保實驗與實驗之間的連續(xù)性。
6.產(chǎn)品僅用于科研試劑或樣品準(zhǔn)備過程中都要使用一次性滅菌的塑料瓶和管子,玻璃器皿應(yīng)洗滌干凈并高壓滅菌。
7.PCR的樣品應(yīng)在冰浴上化開,并且要充分混勻。
犬P物質(zhì)受體(TACR1)分析檢測試劑盒CCTα (D18B6) Rabbit mAb100 ul
牛胎盤生長因子(PGF)分析檢測試劑盒CTDSPL2 (D79G11) Rabbit mAb100 ul
大鼠CCAAT增強子結(jié)合蛋白α(C/EBPα)分析檢測試劑盒Hamartin/TSC1 (D43E2) Rabbit mAb400 ul
猴可溶性細(xì)胞間粘附分子1(sICAM-1)分析檢測試劑盒EGF Receptor (D38B1) XP® Rabbit mAb (Magnetic Bead Conjugate)100 ul
田鼠睪酮(T)分析檢測試劑盒Dynactin p150Glued (D1W1O) Rabbit mAb20 ul
大鼠腎動脈內(nèi)皮細(xì)胞價格Dynactin p150Glued (D1W1O) Rabbit mAb100 ul
RBL-2H3(大鼠嗜堿性細(xì)胞白血病細(xì)胞)報價Phospho-ALK (Tyr1278) (D59G10) Rabbit mAb100 ul
BEL-7405(人肝癌細(xì)胞)價格Phospho-HER2/ErbB2 (Tyr1196) (D66B7) Rabbit mAb100 ul
CTLL-2(小鼠T細(xì)胞)價格NRF1 (D9K7R) Rabbit mAb100 ul
HKC(人腎小管上皮細(xì)胞)報價Phospho-Src Family (Tyr416) (D49G4) Rabbit mAb20 ul
HOS(人骨肉瘤細(xì)胞)價格Phospho-Src Family (Tyr416) (D49G4) Rabbit mAb100 ul
NCI-H226(人肺鱗癌細(xì)胞)現(xiàn)貨供應(yīng)Smad1 (D59D7) XP® Rabbit mAb20 ul
0.05%胰酶(含EDTA)現(xiàn)貨供應(yīng)Smad1 (D59D7) XP® Rabbit mAb100 ul
大鼠胰腺上皮細(xì)胞*培養(yǎng)基價格TNF-α (D5G9) Rabbit mAb100 ul
大鼠小腦顆粒細(xì)胞*培養(yǎng)基價格PINK1 (D8G3) Rabbit mAb20 ul
小鼠肝竇內(nèi)皮細(xì)胞*培養(yǎng)基說明書PINK1 (D8G3) Rabbit mAb100 ul
小鼠腦膜細(xì)胞*培養(yǎng)基價格COPS6 Antibody100 ul
6-FAM 亞磷酰胺單體Micromonospora│sp.分離基物: 池底土斜面培養(yǎng)物安全等級: 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 生理活性物質(zhì);具有抑制彈性蛋白酶的活性培養(yǎng)基: CM0012生長條件: 35-37C存儲條件: 真空冷凍干燥
Pichia│pastoris凍干物安全等級: 1模式菌株: no培養(yǎng)基: 0013生長條件: 30℃存儲條件: 真空冷凍干燥法;礦物油法
Enterobacter│cloacae分離基物: 土壤凍干物安全等級: 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 轉(zhuǎn)糖基β-半乳糖苷酶研究培養(yǎng)基: 2生長條件: 37℃存儲條件: -80℃冰箱凍結(jié)法
Influenzavirus A│Swine influenza virus分離基物: 臟器凍干物安全等級: 2模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 用于科研培養(yǎng)基: 0生長條件: 37存儲條件: 真空冷凍干燥法;
Aspergillus│oryzae凍干物安全等級: 1模式菌株: no培養(yǎng)基: 0013生長條件: 25-28℃存儲條件: 液氮超低溫凍結(jié)法;真空冷凍干燥法
Escherichia│coli分離基物: 病料凍干物安全等級: 2模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 科研及血清定型培養(yǎng)基: 335生長條件: 37存儲條件: 真空冷凍干燥法;
淺紫鏈霉菌種屬: Streptomyces│violascens分離基物: 土壤凍干物安全等級: 1模式菌株: yes應(yīng)用領(lǐng)域: 模式菌株培養(yǎng)基: 0038生長條件: 28℃存儲條件: 液氮超低溫凍結(jié)法;真空冷凍干燥法
Fusarium│semitectum斜面培養(yǎng)物安全等級: 1模式菌株: no培養(yǎng)基: 0014生長條件: 25℃
Cordyceps│japonica f. guangdongensis凍干物安全等級: 1模式菌株: no培養(yǎng)基: 14生長條件: 20-25℃存儲條件: 真空冷凍干燥法