T4 UvsX Recombinase
商品屬性:
產(chǎn)品分類 | 規(guī)格 | 貨號(hào) |
核酸修飾酶系列 | 300μg | BJ-PJ6722 |
核酸修飾酶系列 | 3mg | BJ-PJ6722 |
商品介紹:
描述:
UvsX 重組酶,來源于 T4 噬菌體,是 RecA/Rad51家族的同源體。RecA/Rad51 重組酶家族在雙鏈 DNA 斷裂的無誤修復(fù)和復(fù)制叉重新啟動(dòng)的過程中起到重要作用。
T4 UvsX 重組酶可與其他重組酶一起錨定在單鏈 DNA 上并激活其在其他雙鏈 DNA 上尋找同源序列,以進(jìn)一步完成鏈置換。經(jīng)檢測(cè),該酶無核酸酶活性。
儲(chǔ)存:
置于-20°C 可保存 1 年,-80°C 長期保存,短期使用置于 4°C,保存一個(gè)月,避免反復(fù)凍融。
熱失活:60°C,10min。
酶儲(chǔ)存液:50 mM Tris-HCl, 50 mM KCl, 1 mM DTT, 0.1 mM
EDTA, 10% Trehalose, pH 7.5。2xRPA BufferMix:包含反應(yīng)緩沖鹽、ATP、磷酸肌酸、dNTP、PEG、DTT、BSA 等,可用于 RPA 擴(kuò)增試驗(yàn)。該試劑 4°C
條件下放置 1 個(gè)月性能無下降。
基于本蛋白進(jìn)行 RPA 反應(yīng)測(cè)試的全套試劑
用于 RPA 擴(kuò)增的測(cè)試引物與探針
CPV-F(20uM) CACTTACTAAGAACAGGTGATGAATTTGCTACAG
CPV-R(20uM) AGTTTGTATTTCCCATTTGAGTTACACCACGTCT
Probe(10uM) CCTCAAGCTGAAGGAGGTACTAACTTTGGT[dT-BHQ1]
[THF][dT-FAM]ATAGGAGTTCAACAAG -(C3)
Canine parvovirus type 2,VP2
加入 1μl 的模板 DNA,上機(jī)反應(yīng)前加入 1.25 μl 的 280 mMMg(OAC)2(終濃度 14 mM),總反應(yīng)體積 25 μl?;旌暇鶆颍㈦x心,置于 39-42℃條件下反應(yīng) 30min。
2. 進(jìn)行熒光 RPA 擴(kuò)增在進(jìn)行熒光檢測(cè)時(shí)體系中,額外加入 0.3 μl 的 10μM Probe(120 nM的終濃度)和 50U 的 Exonuclease III(2U/μl 的終濃度),即可進(jìn)行熒光檢測(cè)。本方法應(yīng)用原理為 ExoIII 切割 THF 位點(diǎn),使熒光與猝滅基團(tuán)分離,報(bào)告熒光信號(hào)。
特別說明:
(1) 以上 RPA 擴(kuò)增測(cè)試屬于蛋白功能性測(cè)試,按照以上實(shí)驗(yàn)操作流程,可獲得 RPA 擴(kuò)增產(chǎn)物。進(jìn)一步的優(yōu)化,包括:X、Y、GP32、聚合酶、反應(yīng) Buffer,甚至加樣順序,均可能進(jìn)一步提高 RPA 的擴(kuò)增性能。
(2)關(guān)于 DNA 聚合酶的選擇, 測(cè)試了三種常見的 DNA聚合酶,在進(jìn)行熒光法測(cè)定時(shí),推薦的選擇順序依次為 Bst 4.0>Bsu> Sau,且在 42℃條件下,總能獲得最快的擴(kuò)增速度,且熒光信號(hào)更強(qiáng)。在 Basic 擴(kuò)增中 Sau 表現(xiàn)出特異性擴(kuò)增能力更佳。
(3)關(guān)于 RPA 的靈敏度與非特異擴(kuò)增,在 Basic 試劑的擴(kuò)增中,仍然存在非特異擴(kuò)增產(chǎn)物,這需要進(jìn)一步優(yōu)化反應(yīng)組分及引物序列。在使用熒光探針法時(shí),但由于特異性探針的存在,非特異擴(kuò)增產(chǎn)物通常無熒光信號(hào)值,但此時(shí)會(huì)影響檢測(cè)靈敏度。GP32 蛋白的
濃度增加會(huì)顯著降低非特異性擴(kuò)增,但會(huì)導(dǎo)致擴(kuò)增速度減緩,此時(shí)需要同步增加 X 與 Y 蛋白的用量,以維持 RPA 的擴(kuò)增速度。
(4)據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道,在進(jìn)行試紙條 RPA 實(shí)驗(yàn)時(shí),傾向使用 Nfo 內(nèi)切酶又名 Endonuclease IV, 來對(duì)擴(kuò)增探針進(jìn)行切割,但 未予測(cè)試,目前無法提供相應(yīng)參數(shù)。
(5)RPA 反應(yīng) Buffer 對(duì)擴(kuò)增至關(guān)重要,輕微的濃度差異,均可導(dǎo)致擴(kuò)增效率大幅下降,甚至失敗。RPA BufferMix 為粘稠試劑,使用時(shí)務(wù)必保證加樣準(zhǔn)確,Tip 頭中的殘液務(wù)必打入 EP 管中。
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